很多抗感染的药物可通过胎盘对胎儿造成不良影响，因此孕妇感染后应用要小心。孕期抗感染用药一般分为以下三类：
妊娠期可选用的抗生素：青霉素杀菌的原理是阻碍细胞细菌细胞壁合成，对人体危害小，不会导致胎儿畸形，如青霉素v钾片、羟氨苄青霉素等。头孢菌素类如头孢三嗪、头孢哌酮等化学结构、理化特性等与青霉素类极为相似，不仅对胎儿影响小，而且抗菌谱广，过敏反应发生率低，对肾脏基本无毒性。大环内酯类如罗红霉素、阿奇霉素、克拉霉素等，对胎儿影响小，亦可选用。
妊娠期间不宜用的抗生素：磺胺类可通过胎盘，渗入血脑屏障，致使胎儿脑损伤或新生儿黄疸，故妊娠中、晚期禁用。妊娠期间使用四环素类可致胎儿四肢发育不良、畸形，牙槽发育不良等，故整个孕期禁用四环素类抗生素。氯霉素可通过胎盘在胎儿体内蓄积，新生儿出生后可发生呕吐、厌食、腹胀及“灰婴综合征”等。抗结核药利福平也有致畸作用，妊娠早期禁用。
妊娠期慎用的抗生素：氨基糖甙类耳肾毒性发生率为5%—10%，抗结核药异烟肼易透过胎盘，均应慎用。氟哌酸、环丙沙星等对神经系统有一定影响，灭滴灵有致突变作用，必要时以局部应用为妥。孕期、哺乳期禁用